STMIK INDONESIA menyelenggarakan program studi Sistem Informasi Jenjang Strata 1 (S1) dan program studi Manajemen Informatika jenjang Diploma III (D3). Program Sistem Informasi (S1) dan Manajemen Informatika (D3) mempunyai kompetensi Web Designer, Komputer Multimedia, Jaringan Komputer dan Database Administrator (DBA).

Penyelenggaraan pendidikan didasarkan pada sistem kredit semester untuk program S1 delapan semester dan D3 dengan masa 6 semester. Setelah menyelesaikan pendidikan, program S1 berperan sebagai Sistem Analis  dan Perancang Sistem Informasi dengan gelar Sarjana Komputer(S.Kom). Sedangkan program D3 berpredikat sebagai Programmer Komputer dengan gelar Ahli Madya(A.Md).

Orientasi program Strata 1 (S1) dan Diploma III (D3) dititik beratkan kepada pemenuhan kebutuhan kerja. Dengan demikian diharapkan para lulusan mempunyai pengetahuan, keterampilan dan sikap yang sesuai dengan kebutuhan lapangan kerja. Kemampuan lain yang tidak kalah pentingnya adalah pembinaan mental spiritual.  Guna melayani upaya pencapaian program di atas, maka proporsi pengajaran teori dan praktiknya adalah:

Beban studi Program Studi S1, Sistem Informasi  berkisar antara 146 – 152 SKS dengan perincian sebagai berikut :

Teori berbanding praktikum 62% : 38%
Jumlah SKS  Wajib = 146 SKS

Dengan Uraian SKS sebagai berikut :
Jumlah SKS yang Ditawarkan = 158 SKS
Jumlah SKS Pilihan Yang Ditawarkan = 15 SKS
Jumlah SKS Pilihan Yang Wajib Diambil = 3 SKS

Pelaksanaan program perkuliahan di STMIK INDONESIA berpedoman pada pola pengembangan pendidikan nasional yang menganut sistem kredit semester. Perpindahan mahasiswa dari jalur D3 ke S1 ataupun transfer dari akademi lain yang sejenis dimungkinkan melalui akreditasi, yaitu pola transfer kredit dan penyetaraan bobot matakuliah melalui konsepsi program pendidikan yang diatur dengan aturan akademik tersendiri.

Sistem Satuan Kredit Semester (SKS)
Perencanaan, penyusunan serta pelaksanaan program pendidikan mengacu pada Satuan Kredit Semester (SKS) sebagai tolok ukur beban akademik mahasiswa.

Untuk kegiatan akademik berbentuk kuliah, satu SKS setara dengan upaya mahasiswa sebanyak 3 (tiga) jam seminggu selama satu semester. Upaya itu meliputi :
1. Lima puluh menit interaksi akademik terjadwal dengan staf pengajar
2. Satu jam kegiatan terstruktur
3. Satu jam kegiatan mandiri

Kegiatan terstruktur dilakukan dalam rangka kuliah, misalnya menyelesaikan tugas, membuat laporan, menelusuri literatur, dan sebagainya sedang kegiatan mandiri meliputi persiapan kuliah, membaca literatur, dan sebagainya.

Untuk kegiatan akademik berbentuk praktikum, tugas akhir, magang, dan bentuk sejenisnya, satu SKS setara dengan kerja akademik mahasiswa sebanyak tiga hingga lima jam seminggu dalam satu semester.